Depende administrativamente de la Subsecretaría de Planeación Educativa y la Dirección General de Investigación Educativa. Físicamente se localiza en la Delegación Regional de Servicios Educativos Acapulco-Coyuca
El CIDEA trabaja coordinadamente con el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) al que se encuentra afiliado mediante el Registro Nacional RENIECyT 1273, y que respalda, evalúa y garantiza la calidad de las investigaciones que desarrolla. en la entidad, su personal perteneace al Padrón Estatal de Investigadores que representa el Consejo Estatal de Ciencia, Tecnología e Innovación del Estado de Guerrero (COCYTIEG).
